菌種凍干是利用真空冷凍干燥機對微生物菌種進行長期保存的方法，通過低溫凍結和真空升華脫水，使菌種在干燥狀態(tài)下保持活性，便于長期儲存和運輸。凍干的工藝流程主要包括菌種養(yǎng)、菌懸液制備、預凍、真空冷凍干燥和密封包裝等環(huán)節(jié)。

選擇適宜的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件，使菌種達到最佳生長狀態(tài)，然后通過離心等方法收集菌體，與保護劑混合制成菌懸液。保護劑通常由脫脂乳、蔗糖、谷氨酸鈉等成分組成，能夠有效保護菌細胞在凍干過程中的活性。將菌懸液分裝至凍干瓶中，放入凍干機先預凍，溫度一般控制在<-40℃，使菌懸液完全凍結。隨后在低溫環(huán)境下使冰晶直接升華，這一過程需嚴格控制溫度和真空度，避免菌體受到損傷。

凍干結束后進行充氮密封，確保產(chǎn)品在無氧環(huán)境下保存。菌種凍干技術能夠大限度地保持菌種的活性和遺傳穩(wěn)定性，凍干后的菌粉含水量通常<3%，在常溫下可保存2-3年。該技術廣泛應用于凍干益生菌、凍干工業(yè)發(fā)酵菌種、凍干農(nóng)業(yè)微生物制劑等領域的菌種保藏，解決液態(tài)菌種保存期短、運輸不便問題。